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RNA-seq 比对软件STAR——(1)安装

RNA-seq 比对软件STAR——(1)安装

文章目录

  • RNA-seq 比对软件STAR——(1)安装
    • 一、package下载
    • 二、编译
    • 三、环境配置
    • 四、测试

一、package下载

在GitHub知道package,使用加速复制链接下载。我需要2.7版本以上,所以下载最新版,建议没有特定需求下载最新版,bug修复的差不多了,更便捷

#直接gitclone
git clone https://github.91chi.fun/https://github.com/alexdobin/STAR.git
#或者wget
wget https://github.91chi.fun/https://github.com//alexdobin/STAR/archive/refs/tags/2.7.10a.tar.gz

二、编译

tar zxvf 2.7.10a.tar.gz
cd STAR-2.7.10a
cd source
make STAR

三、环境配置

修改环境 vim ~/.bashrc增加下面一行后source ~/.bashrc

export PATH="/share2/pub/yangjy/yangjy/softs/STAR-2.7.10a/bin/Linux_x86_64_static:"$PATH

在这里插入图片描述
注意:一定是bin目录下的linux_x86_64_static 不是linux_x86_64!! 如果写错了就会出现下图的情形
在这里插入图片描述

四、测试

STAR --version

在这里插入图片描述
OK 啦


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